在子葉展開之前的水分管理比較簡便，即要穴孔基質的下半部一直保持濕潤。僅僅控制穴孔上半部分基質的干濕交替即可。
而在子葉展開之后則要根據環境變化和植株長勢，控制穴孔基質下半部見干見濕。你可以在澆水前挖起一部分基質，觀察下半部分是否有一定的濕度。
穴盤育苗被列為“七五”和“八五”期間重點科技項目。穴盤育苗是歐美70年代興起的一項新的育苗技術，目前已成為許多化商品苗生產的 主要方式。穴盤育苗技術是采用草炭、蛭石等輕基質無土材料做育苗基質，機械化精量播種，西瓜育苗盤，一穴一粒， ---成苗的現代化育苗技術。
穴盤的顏色也影響著植株根部的溫度。一般冬春季選擇黑色穴盤，因為可以吸收更多的太陽能，使根部溫度增加。而夏季或初秋，就要改為銀灰色的穴盤，以反射較多的光線，育苗盤，避免根部溫度過高。而白色穴盤一般透光率較高，桉樹苗育苗盤，會影響根系生長，所以很少選擇白色穴盤。當然白色的泡沫穴盤可以例外。
經過清洗并消毒的穴盤，亦可以重復使用，冬季番茄育苗盤，使用較為安全的季銨鹽類消毒劑，也可以用于灌溉系統的殺菌除藻，避免其中---和青苔滋生。不建議用漂或進行消毒，因為氯會同穴盤中的塑料發生化學反應產生有毒的物質。
穴孔下半部仍舊有一定濕度。
第二天需要對幼苗進行施肥。
利用穴盤可集中育苗、統一管理，育苗時期不受環境---，既可大批量育苗，又可節省勞力。
苗盤入床：將已播種的育苗盤鋪放在苗床中，及時用清水將苗盤澆透，澆水時噴灑要輕而勻，防止將孔的基質和種子沖出，然后在苗床上平鋪覆蓋一層地膜，
桉樹苗育苗使用育苗盤出苗整齊，節省種子，成活率高，移栽方便。
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